离地球不远的邪派基地，
惊破天：这是最后一战，消灭所有博派，消灭那块魔方，突破架构，做永远的宇宙主宰！邪派变形金刚，整队，出发！
邪派在一瞬间卷土重来，地球以通天晓为首的博派则顽强抵抗，出于对地球的保护，博派用魔方诱惑惊破天，将战团逐渐引向宇宙。地球暂时脱离战团。

通天晓身负魔方，战斗中不得不有所保留，随行的sam和丹尼尔等人也是通天晓集团不小的负担。但是，终究逃不出科技领先的惊破天集团的追踪。战斗中，惊破天集团占尽优势，终于，通天晓飞船被击中，迫降一颗有金属光泽的星球，通天晓无奈中打算再次使用魔方，招唤新博派战士。
通天晓打开自己的胸腔，魔方闪耀着五彩的光芒……

荒野，不是地球
扭曲的空间，走出擎天柱和他的探路先锋们。
擎天柱：看来我们到了，这里没有一粒原子的序列是被改动过的。
显微镜：大哥，注意你的言辞
千斤顶：空洞周围也许还有
铁皮：为什么最重要的话非要我说？
大汉：闭嘴，谁也没强迫你，要不你回去！

不远处，一种低等生物，体形微小的头足科变形虫。
大汉撵死一只，说：谁能保证它以后能进化成那样？
擎天柱：原子不会骗人，况且架构也一直停滞在那个状态
千斤顶：一千年之后他们就主宰这个星球，真不敢想象。

远处，头足变形虫，模仿机器人的行走特征，擎天柱等人全然不知。


宇宙深处，
传送带星球
怨恨，伴随着绝望的面孔，难以化销。
地狱般恐怖的机器人垃圾场，实际上是几条往复循环的传送带。支撑传送带的架构就像一幅动物的骷髅。
传送带上偶尔还有几个没有彻底死亡的残肢在抽动，等待他们的是各种物理、化学等方式的回收处理。
传送带星球垃圾场的周围弥漫着瘴气，随着传送带的传动，各道工序时而发出浅蓝色的寒光，被瘴气折射到四周，时不时还发出咯嗞咯嗞的声音
机器人守卫甲：这些垃圾，早知今日何必当初？
不远处，某机器人的残肢被瞬间汽化，弥散于瘴气之中。
机器人守卫乙：哈哈，那家伙“气”死了，哈哈哈哈，它真的不知道？气体也是原子啊，哈哈哈（笑到流泪）

黑暗的空间，
一只丑陋的垂死的头足纲星际怪物
头足怪甲（名字：法官）（头足怪的对话是意识波形式的交流）：哈，奴隶自由之后还能被称作奴隶吗？
头足怪乙（名字：小人）：即便身体是自由的，灵魂是自由的，只要其奋斗的目标仍在客观操控之中，奴隶就永远是奴隶，况且，他们的目标越伟大，就越不会有解脱，哈哈哈哈
法官：我的死亡，也许等于很多欲望的终结，哈哈哈哈
小人：把那些最后的源代码给我吧，我替你延续欲望，趁你所有肢体都被感染之前，我还可以继承你15%的基因。
法官：别想了，你还是盯紧进度吧，第一，我已经进化了，我们之间已经不是同类，第二，如果我放弃进度，自然会康复，我仍然是族群里欲望的象征，第三，我不会彻底死亡，但是也许会放弃我自己所有的软体和硬体。从另一种角度来说我应该感谢这病症。

其实“小人”不知道，不论是进度的完成，还是法官的死亡，对于族群都是天大的好事，但它只觊觎法官的“软”的和“硬”的遗物。

金属光泽的星球，
通天晓
魔方并没有像想象中那样，给周围的金属赋予生命，通天晓却因此当场失去性命
补天士趁乱从抢走魔方，变形汽车，左闪右躲，载着sam和丹尼尔去星球的深处……

Mtv：“别就这样离开”

背景：被冰冻的威震天，注视着对面的魔方360度镜头，第七区域建立（施工的过程）
威震天时代的大黄蜂，周游世界，寻找威震天，寻找魔方。
眼镜，威震天坐标
宇宙中极速飞行的擎天柱等人
魔方从宇宙坠落地球，360度镜头
歌词：别就这样离开
和往常一样，今天，我盼着你回来！
我的心已经，和你，在一起分不开！
你伴随着我，痴狂，憧憬美好时代！
儿时的好梦，醒来，带一点点伤怀！
那一天又见，到你，别就这样离开！
有你在那天，所有，人都不被伤害！
来来来来，变形金刚，自由自在！
来来来来，变形金刚，别就这样离开！
……（待续词填曲）

补天士底盘很低，侥幸躲过了惊破天的追杀，变形，机器人形态。
一个沉闷的声音，只有补天士能听到：年轻人，你准备好了么？
补天士：我准备好什么？
Sam：补天士，你怎么了？
声音：这世界有很多值得人准备的事情，你不觉得么？就像眼前有一桩交易或者赌博，你的筹码越多，你所能交易或者赌博的项目也许就更加诱人。但是，我现在只问你，你准备好了么？
瞬间，补天士脑海里的记忆翻腾了：
可以被任意肢解的没有人身自由的奴隶；
数百万年尔虞我诈的战斗；
和人类相处的短暂的美好的欢乐时光……
就像一条隧道一样，闪过补天士的周身……

补天士：我准备好了（补天士想：准备，无非就是接受，要么接受机遇，要么接受挑战，即使天大的难题或者挑战，为了未来与人类一起美好的时光哪怕豁去自己的生命，也要坚持到底）
……

地球总部（时空变换）
擎天柱（此时的擎天柱已经是多变形态，胸前的两个大玻璃窗依然光亮照人）：不！这不可能，邪派已经销声匿迹了！
补天士：他们依然在试图强行突破架构，未来正变得越来越没有意义。
钢索：等进度完成之后我们就能去3亿年前的过去，未来能见度的缩短似乎和我们到过去没有直接的联系。
通天晓：改变过去就能改变未来么？
丹尼尔：你们没觉得所谓突破从另一个角度来说就是完善么？
上集完


黑暗的宇宙深处，
惊破天：消灭所有反抗力量，统治宇宙！
……


1940年左右
威震天追随魔方降临（二站时）地球，（声波等少数人随行）
声波：这里几乎所有的最高智慧生物都在支持战争，但又都在追求和平，其中肯定有一种奇怪的理念在操纵他们，我们所能接触到的样本太少，太片面了，这里的文明又落后……不如……
威震天：我们至少不应该干扰这场战争，假如把地球的战争根源理念看作是“架构”，那么，魔方对我们的帮助确实太大了。
声波：但是，这个文明也是战争文明，战争升级速度又这么快，甚至掌握了核技术，万一再过几百年……
威震天：那也不能引导他们，你见过哪个文明引导过我们？（威震天有些怒气）
威震天：先设法把魔方控制起来吧，我总觉得魔方根本就不是针对博派的。
……

遥远的宇宙，黑暗中
几只头足纲超进化机械生物
冠王（其中一只）：现在我才明白法官为什么去死了。
小人（其中另一只）：法官已经在进化中超脱，他为我们族群付出的太多了。
暗黑法老：你的意思是说，我们是另一种意义上的奴隶主？就只有法官一个人在奋斗？还有，据说法官放弃了所有的软体和硬体，所有的软体和硬体就是法官的全部么？按照这种理解，是不是说法官的所谓前半生（死之前）在付出，后半生（死之后）就有可能意味着收获呢？
冠王：自从有记忆以来，法官干的每件事都在我们理解范围之外，并且我们也没因为法官的这些行动而遭受任何的损失，甚至，我们随着法官的进化而进化……
暗黑法老：也许法官的自愿死亡是为了族群能够所谓自立，但是你别忘了，他所建立的架构永远只是一个进度，所以永远不能一劳永逸。而现在他又主动去死……
小人：暗黑法老，你在妄想，宇宙中怎么可能有永动机呢！法官最后和我说的一句话是，盯紧进度！
……

宇宙中，
带有金属光泽的星球，
补天士：能问你一个问题么？
低沉的声音：可以，但是我不具有所谓的智慧和感情，因为我不是生命，回答可能不会令你满意。
补天士：我已经问完了，你意外么？
低沉的声音：有时我也在想，其实万事万物就是一个意外，意外的你，意外的我。
低沉的声音：看来我再问你，你准备好了没有已经是多余的了，你走吧，除了这段记忆，我没对你构成任何影响，希望在场的其他人员也是。

1940年左右
擎天柱：看来我们要结束900万年（换算后的时间单位）的战斗了，我打赌，威震天只有等我们到第三行星（地球）之后才有可能使用魔方。哈哈
大汉：威震天是胆小鬼，一定把那颗星球所有可以提炼出的所有金属聚拢在自己周围，等我们一到达，就使用魔方，哈哈
千斤顶：大哥，你的意思是说，威震天更感兴趣的是魔方的移动轨迹而不是魔方？
擎天柱：我也很想念大黄蜂了，几百万年了，真不知道他现在还好么？
擎天柱：博派战士们，整队出发，不管威震天有什么阴谋和意图，我们奉陪到底！


黑暗的宇宙深处，越来越接近传送带星球
强大的邪派军团，从远古到未来的所有邪派变形生物
惊破天：这里为什么没有博派，难道是因为刚才魔方被消灭了？
震荡波：不，越往前就越像那个地方，难道我们要再消灭一次头足怪？惊破天，你怎么了？难道不认识这里？（回忆一亿年前消灭头足怪的战斗，画面惨烈）
声波：邪派没能力单独消灭头足怪族群，惊破天，这是经过论证的，你怎么了？
惊破天：那个声音，啊~~~~~~~~~
惊破天精神失常，暂时被声波、振荡波等人控制。
低沉的声音（古代病毒）再度出现：但是这次你们有能力办到。

邪派在远古病毒支持下开始了最惨烈的与头足怪族群（包括少量死心塌地的机械奴隶）之间的战斗，双方伤亡惨重……
此时魔方再度归来，划开两个宇宙的界限。邪派被带走。

超遥远的未来，
擎天柱和补天士交谈中。
补天士：你一定也去过那里，你们怎么交流的？
擎天柱：你需要帮助么？看来这句话感动了他900万年。哈哈哈哈

不远处是暗藏的惊破天，正用自己的邪恶武器对准这两人。
擎天柱和补天士同时哈哈大笑


镜头转移，
星系，
然后是宇宙。
其实，魔方是围绕那颗有金属光泽的行星的外延。不断赋予金属生命，或者博派，或者邪派。
或者说，博派标志和邪派标志在围绕金属星球运转。
暗黑宇宙里，头足怪的世界，被魔方围绕的那颗行星是传送带星球。


受重伤而肢体残缺的“小人”：看来我们必须完善进度！
受重伤而肢体残缺的“暗黑法老”：你疯了吧，法官一直就是个骗子，我们应该突破架构！
两派对立……